قام الإتحاد الآسيوي بتصنيف الفرق الثمانية المتأهلة إلى الدور الثاني والأخير من تصفيات كأس العالم 2006 إلى أربعة أصناف حسب التالي :
1- فرق المستوى الأول : اليابان وكوريا الجنوبية.
2- فرق المستوى الثانى : إيران والسعودية.
3- فرق المستوى الثالث : البحرين وأوزبكستان.
4- فرق المستوى الرابع : الكويت وكوريا الشمالية.
وسيتم إجراء القرعة وتوزيع الفرق على مجموعتين في ال تاسع من ديسمبر 2004 في كوالالمبور.
وسيكون الدور الثاني من التصفيات على شكل دوري ، يلعب على شكل ذهاب وإياب، حيث يتأهل الفريقان الأول والثاني المتصدران للكل مجموعة مباشرة إلى نهائيات كأس العالم 2006 في حين سيتقابل الفريقان أصحاب المركز الثالث من كل مجموعة والفائز منهم سيقابل فريق من قارة الكونكاكاف للحصول على تذكرة للنهائيات.
